ترجمه مقاله صف بندی موازی برنامه نویسی DNA

ترجمه مقاله صف بندی موازی برنامه نویسی DNA

دانلود فایل

ترجمه طلایی مقاله صف بندی موازی برنامه نویسی DNA صف بندی موازی برنامه نویسی DNAچکیده-در این مقاله ما یک الگوریتم موازی جدید پیشنهاد می کنیم که صف بندی بهینه رشته برنامه نویسی DNA مبتنی بر مدل DNA/protein که توسط Hein پیشنهاد شده است را بمنظور تعیین فاصله بین دو رشته برنامه نویسی DNA محاسبه کند. اثبات خواهیم کرد که این الگوریتم نسبت به الگوریتم ترتیبی، از نظر هزینه بهینه بوده و تطبیقی می باشد. الگوریتم موازی اجرا شده و نتایج آزمایشی، کارایی این الگوریتم را نشان خواهد داد. کلیدواژگان: بیوانفورماتیک، الگوریتم های موازی، تنظیمات رشته. Parallel alignment of coding DNAS.H. Alavi-Soltani, H. Ahrabian1, A. Nowzari-DaliniCenter of Excellence in Biomathematics,School of Mathematics, Statistics, and Computer Science,University of Tehran, Tehran, Iran.Email: {alavi,ahrabian,nowzari}@ut.ac.ir. AbstractWe present a new parallel algorithm that computes an optimal alignment of the coding DNA sequences based on DNA/protein model proposed by Hein for the evaluating distance between two coding DNA sequence. The algorithm is proved to be adaptive and cost optimal with respect to the sequential algorithm. The parallel algorithm is implemented and experimental results show the efficiency of algorithm.Keywords: Bioinformatics, Parallel algorithms, Sequence alignments.1 Introduction 1.    مقدمه [Jones و همکارانش، 2004]. صف بندی رشته در رشته های زیستی، تحت عنوان صف بندی شناخته شده اند. برنامه نویسی دینامیکی روش انتخاب نواحی هم جهت شده رشته های DNA و پروتئینی می باشد. برای تعدادی از طرح های امتیازدهی صف بندی، این روش برای تولید یک صف بندی از دو رشته داده شده، با بیشترین احتمال امتیاز تضمین شده می باشد. امتیاز بندی با در نظر گرفتن فواصل بین دو رشته تغییر می یابد. مکانیزم امتیاز دهی برای دو رشته را می توان با سه مدل مختلف طراحی کرد: مدل DNA، مدل پروتئین، مدل پروتئین/DNA. در این مقاله، با مدل پروتئین/DNA سر و کار خواهیم داشت. حال توضیح مختصری در مورد این سه مدل می دهیم.یک روش سرراست، فاصله تکاملی بین دو رشته برنامه نویسی DNA این است که از برنامه نویسی پروتیئن چشم پوشی کرده و فاصله را با استفاده از چند مدل تکاملی DNA محاسبه کند. فاصله تکاملی بین دو رشته در یک مدل سطح DNA را می توان اغلب بصورت مساله صف بندی کلاسیک فرمول نویسی کرده و بصورت کارایی با برنامه نویسی دینامیکی محاسبه کرد [Jones و همکارانش2004؛ Needlman 1970و همکارانش؛ 1980Waterman].معمولا توصیف فاصله تکاملی بر اساس یک صف بندی از پروتئین های رمزگذاری شده نسبت به یک صف بندی تنها بر اساس برنامه نویسی DNA بیشتر قابل اتکا می باشد [Pearson, 1996].

  • طرح توجیهی سورت و بسته بندی کشمش

    طرح توجیهی سورت و بسته بندی کشمش دانلود فایل طرح توجیهی سورت و بسته بندی کشمش بررسی ابعاد مختلف طرح (معرفی محصول – مالی – منابع انسانی – فضا و …) دارای فرمت PDF می باشد. مفصل و با تمام…

  • طرح توجیهی استفاده از ضایعات صنایع لاستیک سازی در صنعت ساختمان

    طرح توجیهی استفاده از ضایعات صنایع لاستیک سازی در صنعت ساختمان دانلود فایل طرح توجیهی استفاده از ضایعات صنایع لاستیک سازی در صنعت ساختمان نگارش طرح توجیهی یک طرح کسب و کار خوب باید مانند یک داستان، گویا و واضح…

  • ادبیات و تاریخچه (مبانی نظری و سیر تطور) اتوماسیون و نگهداری تعمیرات (به همراه منابع تحقیق)

    ادبیات و تاریخچه (مبانی نظری و سیر تطور) اتوماسیون و نگهداری تعمیرات (به همراه منابع تحقیق),جزوه آموزشی نگهداری و تعمیرات,دانلود ادبیات و تاریخچه اتوماسیون و نگهداری تعمیرات,دانلود پایان نامه ارشد مدیریت,دانلود پایان نامه فوق لیسانس مدیریت,دانلود پایان نامه کارشناسی ارشد…

  • مقاله معماری مسجد احمد ابن طولون

    مقاله معماری مسجد احمد ابن طولون دانلود فایل مقاله معماری مسجد احمد ابن طولون بخشهایی از متن: ابن طولون ، جامع سومین مسجد ساخته مسلمانان در مصر و یکی از بزرگترین مساجد کهن جهان اسلام که به فرمان احمد بن…

  • بررسی تأثیر آموزش مهارتهای زندگی عزت نفس در کودکان دوره پیش دبستانی

    بررسی تأثیر آموزش مهارتهای زندگی عزت نفس در کودکان دوره پیش دبستانی,بررسی تأثیر آموزش مهارتهای زندگی و شیوه های فرزند پروری بر عزت نفس و سازگاری رفتاری در کودکان دوره پیش دبستانی,تأثیر آموزش مهارتهای زندگی سازگاری رفتاری در کودکان دوره…

  • Broadband ISP wimax

    Broadband ISP wimax,پایان نامه Broadband ISP wimax دانلود فایل پایان نامه Broadband ISP wimax  چکیده: برای انتقال اطلاعات، احتیاج به رسانه انتقال و سیستم انتقال می باشد. رسانه های انتقال اجزاء فیزیکی می باشند که انتقال اطلاعات در آنها صورت…

  • پایان نامه بررسی کابردهای تعلیق مجازات در حقوق جزا و رویه محاکم ایران

    بررسی کابردهای تعلیق مجازات,پایان نامه بررسی کابردهای تعلیق مجازات در حقوق جزا و رویه محاکم ایران,پایان نامه کابردهای تعلیق مجازات,قوق جزا و رویه محاکم ایران دانلود فایل پایان نامه بررسی کابردهای تعلیق مجازات در حقوق جزا و رویه محاکم ایران…

  • موسیقی سنتی آذربایجان

    آذربایجان,سنتی,موسیقی,موسیقی سنتی آذربایجان دانلود فایل هر ملتی برای خود ارزش‌ها و آرمان‌هایی دارد كه این ارزش‌ها برای آن ملت جایگاه خاصی دارد. موسیقی نیز یكی از شاخص‌های یك ملت می‌باشد. موسیقی آذربایجان یكی از دی‌نوازترین موسیقی‌های امروزه می‌باشد. مطالبی كه…

  • مبانی نظری و پیشینه پژوهش فرسودگی شغلی

    مبانی نظری و پیشینه پژوهش فرسودگی شغلی دانلود فایل مبانی نظری و پیشینه پژوهش فرسودگی شغلی در 32 صفحه ورد قابل ویرایش با فرمت docx توضیحات: فصل دوم پایان نامه کارشناسی ارشد (پیشینه و مبانی نظری پژوهش) همراه با منبع…

  • مقاله تحقیق درعملیات (پژوهش عملیاتی ) : ابزار بهره وری

    مقاله تحقیق درعملیات (پژوهش عملیاتی ) : ابزار بهره وری دانلود فایل مقاله تحقیق درعملیات (پژوهش عملیاتی ) : ابزار بهره وری نحوه ایجاد بهبود بهره وری واقعی نوشته لئوپرینگل خلاصه مطالب کانون اصلی توجه OA برای مدیریت عبارتند از…

  • سمینار برق بررسی مشخصه های الکتریکی DG-SOI MOSFETs

    سمینار برق بررسی مشخصه های الکتریکی DG-SOI MOSFETs,سمینار برق بررسی مشخصه های الکتریکی DGSOI MOSFETs دانلود فایل سمینار برق بررسی مشخصه های الکتریکی DG-SOI MOSFETs لطفا از این پروژه در راستای تکمیل تحقیقات خود و در صورت کپی برداری با…

  • طرز تهیه نوشیدنی های سالم از طریق طب سنتی

    دانلود آهنگ,دانلود اندروید,دانلود پاورپوینت,دانلود پایان نامه,دانلود پرسشنامه,دانلود پروژه,دانلود سریال,دانلود فایل,دانلود فیلم,دانلود مقاله,دانلود مقاله طرز تهیه نوشیدنی های سالم از طریق طب سنتی,دانلود نرم افزار,دانلود نمونه سوالات,طب سنتی,طرز تهیه نوشیدنی های سالم از طریق طب سنتی,کار در منزل,کسب درآمد اینترنتی,نوشیدنی سالم…

  • پایان نامه بررسی افكار و احوالات امین الدوله

    افكار و احوالات امین الدوله,بررسی افكار و احوالات امین الدوله,پایان نامه بررسی افكا,پایان نامه بررسی افكار و احوالات امین الدوله دانلود فایل پایان نامه بررسی افكار و احوالات امین الدوله چكیده میرزا علی خان معروف به امین الدوله به سال1260هجری…

  • پایان نامه بررسی عکس العمل بازار سهام نسبت به اعلامیه های سود نقدی در بورس اوراق بهادار تهران

    پایان نامه بررسی عکس العمل بازار سهام نسبت به اعلامیه های سود نقدی در بورس اوراق بهادار تهران دانلود فایل [4]

  • بررسی اثرات كلینیكی،رادیولوژیك و هیستوپاتولوژیك، آندروژنها در استخوان سازی و التیام شكستگیها

    بررسی اثرات كلینیكی،رادیولوژیك و هیستوپاتولوژیك، آندروژنها در استخوان سازی و التیام شكستگیها دانلود فایل بررسی اثرات كلینیكی،رادیولوژیك و هیستوپاتولوژیك، آندروژنها در استخوان سازی و التیام شكستگیها چكیده پیشینه و سابقه : استروئیدهای جنسی برای رشد اسكلتی و كسب سلامت استخوانی…

  • ترجمه مقاله مقایسه تکنولوژی پلاسما و تبدیل زباله به انرژی

    ترجمه مقاله مقایسه تکنولوژی پلاسما و تبدیل زباله به انرژی,دانلود آهنگ,دانلود اندروید,دانلود پاورپوینت,دانلود پایان نامه,دانلود پرسشنامه,دانلود پروژه,دانلود تحقیق,دانلود ترجمه مقاله مقایسه تکنولوژی پلاسما و تبدیل زباله به انرژی,دانلود سریال,دانلود فایل,دانلود فیلم,دانلود کتاب,دانلود مدیریت,دانلود مقاله,دانلود نرم افزار,دانلود نمونه سوالات,کار در منزل,کسب…

  • تحقیق انگیزش در كلاس درس

    تحقیق انگیزش در كلاس درس دانلود فایل تحقیق انگیزش در كلاس درس بخشهایی از متن: دانش‌ آموزان دارای انگیزش: معلمان به طور معمول دانش آموزانی را كه سخت كوش، ساعی و علاقه‌مند به دروس باشند، در زمره دانش ‌آموزان خوب…

  • پاورپوینت تیم های مجازی در سازمان

    انواع تیم مجازی,پاورپوینت تیم های مجازی در سازمان,تعریف تیم مجازی,چالش های تیم مجازی,دانلود پاورپوینت تیم های مجازی در سازمان,مدلسازی ساختاری تاثیر ابعاد OCB بر عملکرد تیم های مجازی,موانع توسعه تیم مجازی,ویژگی های تیم مجازی دانلود فایل عنوان: پاورپوینت تیم های…

  • ادبیات نظری وپیشینه پژوهش ارتباط بین اصول ارگونومی و استرس

    ادبیات نظری ارتباط بین اصول ارگونومی و استرس,ادبیات نظری وپیشینه پژوهش,ادبیات نظری وپیشینه پژوهش ارتباط بین اصول ارگونومی و استرس,ارتباط بین اصول ارگونومی و استرس,پیشینه پژوهش ارتباط بین اصول ارگونومی و استرس دانلود فایل جزئیات: توضیحات: فصل دوم پژوهش کارشناسی…

  • نقش توان راكتیو در شبكه های انتقال و فوق توزیع

    دانلود پایان نامه و پروژه پایانی نقش توان راكتیو در شبكه های انتقال و فوق توزیع,نقش توان راكتیو در شبكه های انتقال و فوق توزیع دانلود فایل این پایان نامه با فرمت Word بوده و قابل ویرایش است و همچنین آماده پرینت…

  • پاورپوینت انواع اتصالات در سازه های فلزی

    پاورپوینت انواع اتصالات در سازه های فلزی دانلود فایل پاورپوینت انواع اتصالات در سازه های فلزی دانلود پاورپوینت انواع اتصالات در سازه های فلزی این پاورپوینت در 58 اسلاید می باشد. فهرست مطالب اسلایدها : ساختمان های بنایی و سازه…

  • مبانی نظری سرمایه سازمانی

    مبانی نظری سرمایه سازمانی دانلود فایل مبانی نظری سرمایه سازمانی در 23 صفحه ورد قابل ویرایش با فرمت docx توضیحات: فصل دوم پایان نامه کارشناسی ارشد (پیشینه و مبانی نظری پژوهش) همراه با منبع نویسی درون متنی به شیوه APA…

  • مقاله بررسی جامع مهدی اخوان ثالث

    پروژه بررسی جامع مهدی اخوان ثالث,تحقیق بررسی جامع مهدی اخوان ثالث,دانلود تحقیق بررسی جامع مهدی اخوان ثالث,مقاله بررسی جامع مهدی اخوان ثالث دانلود فایل مقاله بررسی جامع مهدی اخوان ثالث در 85 صفحه ورد قابل ویرایش  فهرست زندگی و آثار.........................................................................................................…

  • تحقیق بررسی اشتباه در مقدار مبیع در حقوق مدنی و حقوق ثبت

    اضافه مساحت و رویه عملی ادارات ثبتی,بررسی ماده 149 قانون ثبت,تحقیق بررسی اشتباه در مقدار مبیع در حقوق مدنی و حقوق ثبت,تحقیق بررسی اشتباه درمقدار مبیع در حقوق مدنی و حقوق ثبت,دیوان عدالت اداری,رؤسای واحدهای ثبتی,شورای عالی ثبت,ماده 355 قانون…

  • طرح توجیهی سفره عقد

    پروژه کارافرینی سفره عقد,توجیه اقتصادی سفره عقد,دانلود پروژه سفره عقد,دانلود کارآفرینی سفره عقد,سفره,طرح توجیه فنی سفره عقد,طرح توجیهی سفره عقد,عقد,کارآفرینی سفره عقد دانلود فایل طرح توجیهی سفره عقد در 19 صفحه ورد قابل ویرایش فهرست 1 ـ توصیف پرنده 2…

  • پایان نامه بررسی بخشش درمانی بر کنترل درونی و بیرونی خشم پسران نوجوان

    پایان نامه بررسی بخشش درمانی بر کنترل درونی و بیرونی خشم پسران نوجوان,پسران نوجوان دانلود فایل پایان نامه بررسی بخشش درمانی بر کنترل درونی و بیرونی خشم پسران نوجوان  فصل اول 1 مقدمه     2 بیان مسئله            4 اهمیت و ضرورت…

  • مقاله شرکت صنایع مس

    مقاله شرکت صنایع مس دانلود فایل مقاله شرکت صنایع مس تاریخچه مس در ایران..................... 1                                                                          راهنمای تایسسات کارخانه................. 2                                                                              کانیهای مس.............................. 4                                                                                                       روش استخراج مس ......................... 5                                                                                           مشخصات معدن............................. 6                                                                                                 جدول ماشین الات معدن .................... 9                                                                                   سنگ…

  • دانلود پاورپوینت تقسیم بازار و تعیین بازار هدف

    بازاریابی انبوه یا یکنواخت,بازاریابی تفکیکی یا تنوع کالا,بازاریابی متمرکز یا هدفدار,تقسیم جغرافیایی,دانلود پاورپوینت تقسیم بازار و تعیین بازار هدف,دلایل اینکه با تمامی متقاضیان بالقوه و بالفعل نمی توان رفتار مشابهی داشت,سیر تکاملی تقسیم بازار,مزایای تقسیم یک بازار بزرگ نا متجانس…

  • سقوط قصاص در نظام حقوقی اسلامی و ایران

    سقوط قصاص در نظام حقوقی اسلامی و ایران دانلود فایل سقوط قصاص در نظام حقوقی اسلامی و ایران آزادی مشروط سقوط دعوامی عمومی اعادة دادرسی فصل دوم علل مشترك سقوط قصاص عفو مجنی علیه بررسی عفو به عنوان مهم ترین…

  • مبانی نظری پایان نامه درباره فرسودگی شغلی

    مبانی نظری پایان نامه درباره فرسودگی شغلی دانلود فایل مبانی نظری پایان نامه درباره فرسودگی شغلی در 40  صفحه ورد قابل ویرایش با فرمت doc توضیحات: فصل دوم پایان نامه کارشناسی ارشد (پیشینه و مبانی نظری پژوهش) همراه با منبع…

  • پایان نامه رابطه بین ترکیب هیئت مدیره و ساختار مالکیت با محافظه کاری حسابداری

    پایان نامه رابطه بین ترکیب هیئت مدیره و ساختار مالکیت با محافظه کاری حسابداری,رابطه بین ترکیب هیئت مدیره و ساختار مالکیت با محافظه کاری حسابداری دانلود فایل پایان نامه رابطه بین ترکیب هیئت مدیره و ساختار مالکیت با محافظه کاری…

  • تحقیق عوامل تأثیر گذار بر خلاقیت

    تحقیق عوامل تأثیر گذار بر خلاقیت دانلود فایل تحقیق عوامل تأثیر گذار بر خلاقیت فهرست: مرور سوابق نظری و پیشینة مورد مطالعه ادبیات و پیشینه تحقیق اجزاء خلاقیت هوش و خلاقیت خلاقیت و پیشرفت تحصیلی خلاقیت و جنسیت رشد خلاقیت…

  • ترجمه مقاله تحقیقات در سیستم تست عملکرد دریچه ی گاز الكترونیكی

    ترجمه مقاله تحقیقات در سیستم تست عملکرد دریچه ی گاز الكترونیكی دانلود فایل ترجمه مقاله تحقیقات در سیستم تست عملکرد دریچه ی گاز الكترونیكی تحقیقات در سیستم تست عملکرد دریچه ی گاز الكترونیكی چکیده : جریان ورودی هوا در سیلندر…

  • پاورپوینت اصول ومبانی مدیریت

    پاورپوینت اصول ومبانی مدیریت دانلود فایل پاورپوینت اصول ومبانی مدیریت ظهور سازمانها و گسترش آنها مدیریت متناسب با ساختار ملاك درستی هر عمل نتیجه تعریف مدیریت  مدیریت، فراگرد به كارگیری موثر و كارآمد منابع مادی و انسانی بر مبنای یك…

  • كشت گردو و موانع پیش رو

    كشت گردو و موانع پیش رو دانلود فایل كشت گردو و موانع پیش رو فهرست  1-        مقدمه: 2-        خصوصیات گیاه‌شناسی گردو 3-        اهمیت و گسترش قارچهای شبه جنس Cytospora 4-        ویژگی‌های شبه جنس Cytospora 5-        اهمیت و اهداف این تحقیق:…